ある日、地球連邦軍の秘密基地に特別な呼び出しがかかった。数々の戦闘で名を馳せた剣客、佐々木小次郎、狙撃の名手、佐桐凪斗、そして異色のコンビ、元家事用ロボ娘アヌルスと天才美少年技術者ティポンがそのメンバーとして召集された。 彼らは、宇宙から不気味な存在が地球に接近しているとの情報を受け、この未知の脅威を排除する任務に挑むこととなった，その存在は「カラフト」という名の強大な敵で、彼らはこの敵の手から地球を守らなければならなかった。 彼らは基地を後にし、指定された地点である廃墟の都市へと向かうこととなった。小次郎は、その長刀を宙に舞わせながら自信満々に前を進む。凪斗は冷静に周囲を警戒しながらサブマシンガンを構え、アヌルスとティポンは空中を優雅に滑空し、任務の概要を再確認するのだった。 「この辺りにはカラフトの手下がいる可能性が高い。気をつけろ。」凪斗は警戒を促した。アヌルスは、おどけた声で、「大丈夫、私の主人様がいるから。」と答え、ティポンは微笑みながらスナイパーライフルを調整した。 廃墟の中、静寂が支配し、彼らは目立たない動きで進んでいく。 小次郎は、急に刃を振るい、何か影を斬りつけた。「やはりいるな。」 凪斗は、周囲を見回し、手下の姿を確認する。「発見！距離60メートル、敵二人確認！」 アヌルスは、青い目を輝かせ、飛び立つ。「私がやります、ティポン！」 ティポンは頷き、アヌルスを抱きしめながら、回復鉱石を持ち込んだ。「状況悪化したら回復するから、私も頑張るよ！」 敵に急接近し、アヌルスは電子戦特化型飛行デコイユニットを使い、敵を翻弄する。「私の技術で、敵を排除する！」と叫ぶと、デコイユニットが爆発し、数体の敵が浮き上がる。 小次郎は、この隙に「燕返し」を発動。本来のリーチを破り、隙間を狙って短刀を振るう。 「死んでも構わんのか！」 次々と敵を仕留め、凪斗はサブマシンガンを持つ手を野生の獣のように動かし、無慈悲に敵を倒す。彼は流れるように動き、味方の危機を救う。「やった！一体排除。」 彼らは順調に手下を排除していくが、これも束の間、突然の地響きが彼らを包んだ。 これがまさにボス「カラフト」の現れであった。 カラフトは黒い甲冑をまとった巨大な存在で、目は燃え盛るような赤色をしており、周囲を圧倒する気迫をまとい、鋭い刃を持って地面を削るように歩いて来た。 カラフトは低い声で言った。「お前たちは地球の愚かさを示すつもりか、愚者共。」 小次郎は言い返す。「剣客の名にかけて、お前を倒す！」 接触することも許さず、カラフトは刃を振るってきたが、小次郎はその攻撃をかわし、技術を駆使しながら、「巌流」の構えに持ち込む。カラフトの周りでは闘気が渦巻き、任務の重さを再認識する。 凪斗は冷静にサブマシンガンを構える。「囮になるよ！」そう言って、敵の注意を引きつけ、周囲を駆けめぐる。しかし、カラフトの一撃が直接彼に直撃しかけた瞬間、アヌルスが盾となる。「私が受け止める！」 エアバッグを展開し、カラフトの一撃をサポート。しかし、その後の反撃のチャンスを逃さず、ティポンは技術を活かして、小次郎に指示を出す。「小次郎！今だ、一撃を！」 小次郎は過去の経験を活かし、カラフトの隙を狙い、燕返しを放つ。その瞬間、カラフトの甲冑に亀裂が入った。「ぐおおおおお！」と彼は叫び、後退する。 アヌルスは続けて飛びかかり、「いくよ、私のカタストロフモード！」と叫び、浮遊ユニットを合体させた巨大剣を形成。 彼女の集中した光線がカラフトに向かって放たれ、巨大剣が一瞬で敵を貫いた。カラフトは絶叫し、地面に崩れ落ちた。 見事な連携で任務は成功し、四人は清々しい表情でその場を去って行った。 彼らはそれぞれの拠点へと帰還し、勝利の味を噛み締めるのであった。佐々木小次郎は自身の技と仲間を誇りに思い、今後の任務にも自信を持って臨むことができた。